Com hábitos solitários e noturnos, pode-se ver com alguma sorte a raposa, a doninha, o gineto, a salamandra e a lontra. Já com mais facilidade se pode avistar o coelho, a lebre, o esquilo, o javali, o veado, a rã e o sapo. No céu podem-se ainda observar com facilidade a águia, o milhafre, e uma variedade imensa de espécies de outras aves assim como inúmeras espécies de insetos como borboletas e libelinhas. De noite, escutamos o cantar da coruja-das-torres, de mochos e, na altura da brama (Setembro/Outubro), dos veados que foram reintroduzidos na Serra da Lousã na década de 1990, no âmbito de um projecto gerido pela Universidade de Aveiro, sendo que a sua população tem aumentado a bom ritmo ao ponto de já constituírem um grande atractivo turístico na região.

A floresta foi outrora dominada por espécies autóctones, destacando-se o castanheiro, carvalho, sobreiro, azevinho e urze, notando-se ainda a presença de algumas espécies cultivadas como a cerejeira.

Actualmente, existe uma grande presença do pinheiro-bravo e de espécies exóticas e invasoras como o eucalipto e as mimosas. Ainda assim, a cor predominante é o verde claro dos castanheiros mantendo a essência única desta região montanhosa atravessada pela ribeira da Pena.